聚类热图

可视化分析

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分析进度

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错误信息

📁 主任务文件(用于后续分析) (继承自父任务)

结果文件

🔄 调整参数再分析

只有以下参数可以在子任务中调整

暂无子任务

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工具简介与使用场景

聚类热图 工具主要用于绘制热图以展示基因/样本的表达模式。

绘制基因表达数据的聚类热图,支持样本分组注释

主要应用场景:

  • 展示差异基因在不同样本中的表达模式
  • 对样本进行无监督聚类,辅助识别亚型或异常样本

可实现的功能:

  • 层次聚类/行列缩放
  • 定制配色与注释条
  • 支持选择展示Top基因

参数详解

参数实际意义与建议设置
inputFile基因表达矩阵(行为基因,列为样本)
必填
默认值:
groupFile实验分组/对照设置:用于定义比较的两组(或多组)样本以及参考组。建议:参考组通常设为"对照/未处理",确保分组与样本注释一致。
必填
默认值:
scaleMethod分析方法选择:不同方法对数据分布假设与稳健性不同。建议:RNA-seq差异分析可选DESeq2/edgeR;微阵列可选limma;富集分析可选超几何/ORA或GSEA。
必填
默认值: row
clusterCols聚类方法:决定样本/基因如何合并成簇。建议:层次聚类(complete/average)直观,k-means适合较大样本且需预设簇数。
必填
默认值: yes

输入文件要求

请确保您的输入文件格式正确,这是分析成功的基础。通常,您需要提供一个包含基因/蛋白表达量的数据矩阵。

该工具暂未提供示例文件。请参照通用格式,通常为CSV或TXT文件,第一列为基因/蛋白ID,后续列为各样本的表达值。

常见问题 (FAQ)

Q: 分析需要多长时间?

A: 预计执行时间为 10 秒左右,具体时间取决于您数据的大小和服务器当前负载。

Q: 如果分析失败了怎么办?

A: 如果分析失败,系统将不会扣除您的积分。您可以首先检查输入文件格式是否与示例文件一致,或根据错误提示调整参数。如果问题仍然存在,请通过页面的反馈功能联系我们。

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